Genetic Diversity of the 18 Commercial Waxy Corn Cultivars Based on SRAP Markers
Keywords:
DNA markers, Genetic diversity, Waxy corn, Sweet cornAbstract
This study was to evaluate genetic diversity of 18 varieties of waxy corn, including 2 hybrid varieties, 13 open-pollinated varieties and 3 exotic varieties compared to 2 varieties of sweet corn by using SRAP markers (Sequence-Related Amplified Polymorphism). It was found that 12 primers provided 61 polymorphics of DNA band. Analysis of genetic relationship and cluster by using Unweighted pair group method with arithmetic averages (UPGMA) showed that the waxy corn and the sweet corn could be grouped according to Dice’s similarity coefficient (0.35-0.76) into 4 groups. Group 1 included 2 varieties of hybrid waxy corn ‘Violet white-926’ and an exotic variety ‘Chinawax-23’. Group 2 included commercially hybrid sweet corn (Supersweet-3A and Supergold) and F1 hybrid variety of waxy corn (Bigwhite#854), open-pollinated varieties (White Hawk, Hueplee-20, Snowwhite-seedlines, Pum-pui-Singto and Khaw-niuw-wan-14) and two exotic varieties (Chinawax-2 and Chinawax-2000). The open-pollinated varieties of waxy corn, which were consisted of Kai-mook-Pum-pui, Nakhon Pathom, Eight-row and Snowwhite) were grouped into the third group. Group 4 had only 2 varieties of open- pollinated waxy corn with a small ear type; Khao-kawniuw and Num-Nan. But there were 2 cultivars with small ear type in out group that were Numyom and Numwang. The result of the study indicates that there is genetic variation among the waxy corn varieties evaluated, which is able to select the parental lines for developing a breeding population
References
กิตติยา โพบำรุง. 2554. การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของข้าวโพดข้าวเหนียวและข้าวโพดเทียน. ปัญหาพิเศษปริญญาตรี สาขาวิชาเทคโนโลยีชีวภาพทางการเกษตร มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์.
ทวีศักดิ์ ภู่หลำ. 2540. ข้าวโพดหวาน การปรับปรุงพันธุ์และการปลูกเพื่อการค้า. โอเดียนสโตร์, กรุงเทพฯ. 143 หน้า.
ทิพย์ เลขะกุล. 2529. ข้าวโพดข้าวเหนียวและข้าวโพดเทียน. ชาวเกษตร 67:4-17.
ประภา กัณฐศากุล, สุทัศน์ ศรีวัฒนพงศ์ และจินดา จันทร์อ่อน. 2535. ส่วนประกอบบางอย่างของข้าวโพดฝักสด, น. 1-3. ใน เอกสารประกอบการสัมนาข้าวโพดหวาน, ณ ศูนย์วิจัยพืชไร่เชียงใหม่, เชียงใหม่.
สุรินทร์ ปิยะโชคณากุล. 2552. เครื่องหมายดีเอ็นเอ: จากพื้นฐานสู่การประยุกต์. สำนักพิมพ์มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์, กรุงเทพฯ. 269 หน้า.
องค์การตลาดเพื่อเกษตรกร. 2552. คู่มือการถ่ายทอดเทคโนโลยี โครงการส่งเสริมการผลิตสินค้าเกษตรที่ได้มาตรฐานและปลอดภัย. กรุงเทพ ฯ. 10 หน้า.
Fergason, V.L. 2001. High amylose and waxy corns, pp. 63-84. In A.R. Hallauer, ed. Specialty corns. CRC Press, USA.
Jingade, P., A. K. Huded, B. Kosaraju, and M. K. Mishra. 2019. Diversity genotyping of Indian coffee (Coffea arabica L.) germplasm accessions by using SRAP markers. J. Crop Improve. 33(3):327–345.
Li, G. and C.F. Quiros. 2001. Sequence-related amplified polymorphism (SRAP), a new marker system based on a simple PCR reaction: its application to mapping and gene tagging in Brassica. Theor. Appl. Genet. 103: 455-461.
Pan, D., W. Yu-Ming, C.Guo-Yue, L. Wei, W. Ji-Rui, N. Eviatar and Z. You-Liang. 2010. Sequence-related amplified polymorphism (SRAP) of wild emmer wheat (Triticum dicoccoides) in Israel and its ecological association. Biochem. Syst. Ecol. 38: 1–11.
Pineda-Hidalgo, K.V., K.P. Méndez-Marroquin, E.V. Alvarez, J.Chávez-Ontiveros, P. Sánchez-Peña, J.A. Garzón-Tiznado, M.O. Vega-Garcia and J.A. López-Valenzuela. 2013. Microsaltellite-based genetic diversity among accessions of maize landraces from Sinaloa in Mexico. Hereditas 150(4-6): 53-59.
Sanchez, G.J.J. and M.M. Goodman. 1992. Relationships among the Mexican races of maize. Econ. Bot. 46(1):72-85.
Thakor . M. C., R. S. Fougat, S. Kumar and A. A. Sakure. 2019. Sequence-related amplified polymorphism (SRAP) analysis of teak (Tectona grandis L.) germplasm. Ecol. Genet. Genom. 12: article 100041.
Zhang, X., H. Chen, S. A. Channa, Y. Zhang, Y. Guo, M. Klima, F. Yu. and S. Hu. 2017. Genetic diversity in Chinese and exotic Brassica rapa L. accessions revealed by SSR and SRAP markers. Braz. J. Bot. 40 (4): 973–982.
